Het Huis van Compassie werkt vanuit overtuiging graag samen met vele organisaties en initiatieven in Nijmegen; er zijn in Nijmegen immers velen die evenals de diaconie gerechtigheid en solidariteit hoog in hun vaandel hebben. Door krachten te bundelen kunnen initiatieven immers worden versterkt.

Voorbeelden van samenwerkingspartners van het Huis van Compassie zijn:

• Amnesty Nijmegen
• Beweging van Barmhartigheid
• Boskapel
• Bij Bosshardt Nijmegen
  
• KUS (Kunst van Samenleven)
• Lets Nijmegen
• Centrum voor Ontmoeting in Levensvragen
• Diaconie Nijmegen
• Hobbycentrum Nonnendaal
• Quiet Nijmegen
• Raad voor Levensbeschouwing
• Repaircafe Nijmegen
• Stichting ElanArt
• Stichting GAST
• Vincent de Paul Center
• Voedselbank
• Vluchtelingenwerk Oost NL
• Vrijwilligerscentrale
• Wereldvrouwenhuis
• Wijkfabriek
• Zorgcafé
• Zelfregiecentrum